![]() |
S-114 kurssien kuvaukset |
Huom: Tätä sivua ei enää ylläpidetä. Uusille BECS-opetussivuille pääsee täältä.
28 + 28 (2 + 2) sl
Opettaja: opettava tutkija, dos., FT Mika Ala-Korpela
Sisältö: Tietokoneavusteisen matemaattisen
mallintamisen perusteet luonnontieteissä ja tekniikassa; esim.
kvanttimekaaninen mallinnus, elektronirakenteet ja
voimakentät, spektroskopisen datan analyysi,
simulaatiomenetelmät, Lattice-Boltzmann –mallinnus,
geenien ja proteiinien analyysi, kompleksiset vuorovaikutusverkostot.
Keskeisiä menetelmiä ja algoritmeja; esim.
interpolointi ja ekstrapolointi, integrointi ja optimointi,
lineaaristen yhtälöryhmien ratkaiseminen,
käyrän sovitus, viivanmuotosovitus,
epälineaariset mallit, datan tilastollisia
peruskäsitteitä, Fourier-muunnos ja sen sovelluksia,
Monte Carlo –mallinnus, molekyylidynamiikka.
Tietokoneharjoituksia.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyöt.
Kirjallisuus: Luentomateriaali ja erikseen ilmoitettavat artikkelit /
viitteet. Kirjat: Numerical mathematics and computing, 4th edition, W.
Cheney, D. Kincaid, Brooks/Cole (1999) ja Numerical Recipes (in C++ /
Fortran), The Art of Scientific Computing. W. H. Press, S. A.
Teukolsky, W. T. Vetterling, B. P. Flannery, Cambridge University
Press, Second Edition (1992, 2002).
Esitiedot: Matematiikan peruskurssit S1-S3. Jonkin ohjelmointikielen
hallinta on suotavaa (lähinnä C tai Fortran).
HUOM: Korvaa kurssin S-114.100
I-II
Opettaja: DI Janne Ojanen
Sisältö: Opintojakso antaa valmiudet
informaatioteorian soveltamiseen ja mallintamiseen keskittyen
malliluokan valinnan, mallin parametrien optimaalisen
lukumäärän ja parametri arvojen
määrittämisen informaatioteoriaan
pohjautuviin mallinnusperiaatteisiin.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyö.
Kirjallisuus: T.M. Cover and J.A. Thomas: Elements of Information
Theory. Y. Sakamoto, M. Ishiguro Statistical Inquiry, ja muu luennoilla
ilmoitettava kirjallisuus.
Esitiedot: Tilastomatematiikan ja
todennäköisyyslaskennan perusteet.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.310.
(4 + 4) III-IV
Opettaja: prof. Jukka Tulkki ja prof. Ilkka Tittonen
Sisältö: Aineen mikrorakenteen fysiikan perusteet. de
Broglie aallonpituus, Planckin fotonihypoteesi, Schrödingerin
yhtälöt, vetyatomi, elektronin spin, Paulin
kieltosääntö, kvanttistatistiikkaa, mustan
kappaleen säteily, elektronitilat molekyyleissä ja
kiinteässä aineessa, johtavuus ja
hilavärähtelyt.
Suorittaminen: Tentti tai välikokeet + laskuharjoitukset.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssit S-114.325
ja S-114.326.
(2 + 4) III-IV
Opettaja: prof. Jukka Tulkki ja prof. Ilkka Tittonen
Sisältö: Aineaaltodynamiikka ja Ehrenfestin teoreema,
johdatus kvanttimekaniikan operaattoriformalismiin ja kvanttimekaniikan
postulaatit, molekyylien ja kiinteän aineen
elektronirakenmolekylberäteen laskentamenetelmät,
elektronitilat metallien ja puolijohteiden kvanttirakenteissa,
johtavuus ballistisissa aaltoputkissa.
Suorittaminen: Kurssi suoritetaan osallistumalla laskuharjoituksiin ja
tekemällä tietokoneharjoitukset
HUOM: S-114.1327 ja S-114.1427 yhdessä korvaavat opintojaksot S-114.425
ja S-114.426.
I periodi
Opettaja: ma. prof. Iiro Jääskeläinen
Sisältö: Perehdyttää opiskelijat
ihmisen kognitiivisiin prosesseihin (tarkkaavaisuus, muisti,
havaitseminen, toiminnan ohjaus ja emootiot) sekä niiden
keskushermostollisiin mekanismeihin. Hermosolu aivojen laskennallisena
perusyksikkönä, plastisiteetti,
välittäjäaineet. Lisäksi
tutustutaan systeemisen neurotieteen tutkimusmenetelmiin ja
neurotieteen sovelluksiin.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitukset.
Kirjallisuus: Gazzaniga, Ivry and Mangun (2002): Cognitive
Neuroscience, The Biology of the Mind (2. painos) sekä
opetuksen yhteydessä jaettava materiaali.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssit
S-114.790 ja S-114.101.
III-IV
Opettaja: dos Mika Ala-Korpela
Sisältö: Seminaarin tarkoituksena on antaa
harjoitusta esitelmän laatimisessa, sen
pitämisessä ja esittämisen
kritiikissä. Sisällöstä ilmoitetaan
tarkemmin ennen opintojakson alkua. Suorittaminen:
Seminaariesitelmät, kirjallinen versio
esitelmästä. Ei tenttiä.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.240.
I-II
Opettaja: FT Peter Engelhardt ja vierailevia asiantuntijoita
Sisältö: Opintojakso antaa perusteet
solubiosysteemien toimintaan keskittyen genomiikkaan (geenit, DNA ja
RNA), proteomiikkaan (proteiinien synteesi ja rakenne ja
vuorovaikutukset) soluaineenvaihduntaan ja signalointiin.
Suorittaminen: Tentti, harjoitukset.
Kirjallisuus: Alberts et al. Molecular Biology of The Cell, 4th ed,
Garland Science, 2002, ch. 4-8.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.500.
V I-II, III-IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Seminaari käsittelee vuosittain
ajankohtaista bioinformaatioteknologian aluetta.
Suorittaminen: Opiskelija tekee sovitusta aiheesta
seminaarityön, esittelee sen seminaarissa ja osallistuu
seminaari-istuntoihin, opponointi.
Kirjallisuus: Ilmoitetaan seminaarin alussa.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.502.
I-II, III-IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Seminaari ajoittuu
diplomityövaiheeseen. Sen voi suorittaa myös
erikoistyövaiheessa tai muun tutkimusprojektin aikana.
Seminaarissa käsitellään
tutkimussuunnitelman ja tutkimusraportin laadintaa. Opiskelija laatii
tutkimussuunnitelman omasta tutkimustyöstään
ja esittelee sen seminaarissa. Työn edetessä
opiskelija esittelee työtään 2-4 kertaa.
Lopuksi opiskelija pitää esitelmän valmiista
työstä. Jokainen opponoi seminaarin kuluessa jonkun
toisen työtä.
Suorittaminen: Osallistuminen seminaari-istuntoihin,
tutkimussuunnitelman laadinta, oman tutkimustyön esitteleminen
eri vaiheissa, opponointi.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.503.
I-II, III-IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Seminaari ajoittuu
diplomityövaiheeseen. Sen voi suorittaa myös
erikoistyövaiheessa tai muun tutkimusprojektin aikana.
Seminaarissa käsitellään
tutkimussuunnitelman ja tutkimusraportin laadintaa. Opiskelija laatii
tutkimussuunnitelman omasta tutkimustyöstään
ja esittelee sen seminaarissa. Työn edetessä
opiskelija esittelee työtään 2-4 kertaa.
Lopuksi opiskelija pitää esitelmän valmiista
työstä. Jokainen opponoi seminaarin kuluessa jonkun
toisen työtä.
Suorittaminen: Osallistuminen seminaari-istuntoihin,
tutkimussuunnitelman laadinta, oman tutkimustyön esitteleminen
eri vaiheissa, opponointi.
III-IV
Opettaja: TkT Jukka Heikkonen
Sisältö: Opintojaksossa
käsitellään keskeisimpiä
systeemibiologian laskennallisia menetelmiä liittyen
geenikartoitukseen, DNA ja RNA sekvenssien ja mikrosirujen
analysointiin (genomiikka) ja proteiinien rakenteeseen (proteomiikka).
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyö.
Kirjallisuus: Joao Setubal: Introduction to Biological Computing. Muu
kirjallisuus ilmoitetaan luentojen alussa.
Esitiedot: S-114.500
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.510.
I-II
Opettaja: dos. TkT Aki Vehtari
Sisältö: Bayesilainen
todennäköisyysteoria ja bayesilainen
päättely. Bayesilaiset mallit ja mallien analysointi.
Laskennalliset menetelmät, Markov-ketju Monte Carlo.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyö.
Kirjallisuus: Gelman, Carlin, Stern & Rubin: Bayesian Data
Analysis, Second edition, sekä luennolla ilmoitettu materiaali.
Esitiedot: Tilastomatematiikan ja
todennäköisyyslaskun perusteet.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.601.
II periodi
Opettaja: dos. Kaisa Tiippana
Sisältö: Ihmisen näkö- ja
kuulohavaintoihin liittyvät perusilmiöt ja
-mekanismit, aistien yhteistoiminnan ja motoristen toimintojen
perusteet, havaitsemisen tutkimuksessa käytettävien
keskeisten tekniikoiden perusperiaatteet.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitukset.
Kirjallisuus: E. Bruce Goldstein (1999): Sensation and Perception (5.
tai uudempi painos), New York: Brooks Cole Publishing ja opetuksen
yhteydessä annettava materiaali.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.780.
III
Opettaja: FT Jari Kätsyri, DI Mikko Viinikainen, tekn.yo.
Katri Koskentalo
Sisältö: Kurssissa perehdytään
ihmisen emootioihin, sosiaalisemotionaalisen kommunikaation
mekanismeihin ja näiden tietojen
hyödyntämiseen ihminen-tietokone
käyttöliittymissä. Kurssiin
liittyvissä harjoitustöissä
tehdään emootioihin ja sosiaaliseen kommunikaatioon
liittyviä laboratoriokokeita ja analysoidaan niiden tuloksia
ja keskustellaan tulosten merkityksestä
Suorittaminen: Tentti, harjoitukset. Kirjallisuus:Oatley, K. and
Jenkins, J.M.: Understanding emotions, Cambridge MA: Blackwell
Publishers, 1996 tai uudempi painos, sekä opetuksen
yhteydessä ilmoitettava materiaali.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.760.
IV
Opettaja: FT Riikka Möttönen
Sisältö: Kurssilla perehdytään
puheen neurokognitiivisiin mekanismeihin. Kurssiin liittyvissä
harjoitustöissä puheeseen liittyviä
laboratoriokokeita ja analysoidaan niiden tuloksia.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitukset.
Kirjallisuus: Ilmoitetaan opintojakson alussa.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.710.
IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Kurssilla perehdytään
syvällisesti ihmisen muistijärjestelmiin ja niiden
keskushermostolliseen perustaan. Sensorinen muisti, työmuisti
ja tarkkaavaisuus, pitkäkestoinen muisti. Episodinen muisti ja
semanttinen muisti. Muistin häiriöt. Muistin
hermosolu- ja hermoverkkomalleja.
Suorittaminen: Tentti.
Kirjallisuus: Ilmoitetaan kurssin alussa.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.771.
I tai II tai III tai IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Johdatus neuroinformatiikan osa-alueisiin.
Informaatioteknologian hyödyntäminen
neurotieteissä. Tilastollinen mallintaminen
neuroinformatiikassa. Tietokannat neuroinformatiikassa ja
interoperabiliteetti. Neuroinformatiikan sovellusalueet.
Suorittaminen: Kurssi suoritetaan joko luentopohjaisena tai
seminaarityöskentelynä.
Kirjallisuus: Kurssilla jaettava materiaali
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.801.
III
Opettaja: TkT, KTT Juuso Töyli
Sisaltö: Peli antaa osallistujille kokonaisvaltaisen kuvan
yrityksen eri toiminnoista ja niiden välisistä
riippuvuuksista sekä tarjoaa mahdollisuuden strategisen ja
operatiivisen johtamisen ja kasvun hallinnan harjoitteluun. Yrityspeli
mahdollistaa liikkeenjohdollisten kykyjen koettelun oppirahoja
maksamatta, sekä tiimityöskentelyn harjoittelemisen
aikapaineen alla.
Suorittaminen: Neljän opiskelijan muodostamat yritykset
kilpailevat toisiaan vastaan samassa pelissä.
Pääkset tehdään mikroluokassa,
ohjattujen pelisessioiden aikana. Kaikkien osallistujien
läsnäolo jokaisessa pelisessiossa
välttämätön. Kurssin suoritukseen
kuuluu pelin lisäksi oman yrityscasen kirjallinen alku- ja
loppuraportti.
Kirjallisuus: Pelin virtuaalimaailman kuvaus jaetaan avausluennolla.
Lisätietoja: Myös koodilla T-124.5600.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.155/TU-22.164.
I-II
Opettaja: prof. Jouko Lampinen
Sisältö: Opintojaksolla perehdytään
epälineaarisiin tilastollisiin mallinnusmenetelmiin.
Pääpaino kurssilla on neurolaskentaan perustuvissa
menetelmissä ja niiden suhteessa muihin tilastollisiin
mallinnusmenetelmiin. Tavoitteena on antaa teoreettiset ja
käytännön valmiudet neuroverkkomallien
suunnitteluun ja analysointiin.
Kirjallisuus: Kokoelma kurssin yhteydessä ilmoitettuja
artikkeleita, ja C. Bishop, Neural networks for pattern recognition,
Oxford Press, 1995
Esitiedot: T-61.261 suositellaan.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.200.
I-IV
Opettaja: akatemiaprof. Kaski, prof. Lampinen, akatemiaprof. Sams,
prof. Tulkki
Sisältö: Opintojakso koostuu laskennallisen tekniikan
aihepiiriin liittyvästä
erikoistyöstä.
Kirjallisuus: työmonisteet
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.215.
IV
Opettaja: Ph.D. Mikko Karttunen
Sisältö: Kurssilla perehdytään
stokastisiin simulointimenetelmiin ja niiden sovellutuksiin painottuen
erilaisten kuljetus- ja kasvatusilmi öiden mallintamiseen.
Suorittaminen: Kurssin suoritus koostuu laskuharjoituksista ja
lopputyöstä.
Osallistujamäärästä riippuen osa
laskuharjoituksista voidaan korvata seminaariesityksellä.
Kirjallisuus: D.W.Heermann: Computer Simulation Methods in Theoretical
Physics; K.Binder&D.W.Heermann: Monte Carlo Simulation in
Statistical Physics, D.Frenkel&B.Smit: Understanding Molecular
Simulation: From Algorithms to Applications; A.Kersch&W.J.
Mokoroff: Transport Simulation in Microelectronics, Springer-Verlag
1995.
Esitiedot: Statistisen fysiikan perusteet.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.250.
III-IV (parittomina vuosina)
Opettajat: prof. Jukka Tulkki ja N.N.
Sisältö: Energiatilojen kvantiuminen
kerrospuolijohteissa, Kohn- Luttinger teoria, fotonien absorptio ja
emissio, ei-lineaariset optiset ominaisuudet, jännitetyt
puolijohderakenteet.
Suorittaminen: Tentti, laskuharjoitukset ja harjoitustyö.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.401.
III-IV
Opettaja: TkT Jukka Heikkonen, FT Peter Engelhardt, prof. Kimmo Kaski
Sisältö: Opintojakso koostuu laskennallisen
rakennebiologian aihepiiriin liittyvästä
erikoistyöstä.
Suorittaminen: Erikoistyö.
Kirjallisuus: Työmonisteet.
Lisätietoja: S-114.520
III-IV
Opettaja: dos. FT Mika Ala-Korpela
Sisältö: Biologisten eliöiden ja koneiden
informaatiojärjestelmien rakennetta, toimintaa ja
vuorovaikutusta, ihmisen anatomiaa, fysiologiaa ja hermoston toimintaa,
ihmisen ja koneen älykkyys, implantit ja keinoelimet,
systeemibiologian perusteita, molekylaarisen bioteknologian perusteita,
kantasolut ja uudet lääketieteelliset hoitomuodot,
tulevaisuuden käyttöliittymiä, robotit,
oppivat ja älykkäät
järjestelmät kuluttajatuotteissa, uusia
tieteellisiä saavutuksia - esim. ajatusohjaus ja
keinosilmä, alueen liiketoiminnallisia mahdollisuuksia,
elokuvia, tulevaisuuden kuvia ja eettistä pohdintaa.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyö.
Kirjallisuus: Luentomateriaali ja erikseen ilmoitettavat artikkelit /
viitteet.
Kirjat: Cyborg - the man-machine, Marie O'Mahony ja Inhimillinen kone -
konemainen ihminen, Eero Hyvönen (toim.).
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.530.
S-114.3760 Elektroenkefalografian mittauskurssi (6 op) L
II periodi
Opettaja: Laura Kauhanen ja prof Christina Krause
Sisältö: Elektroenkefalografia (EEG) ja sen
sovellukset aivotutkimuksessa. Luennoilla
käsitellään EEG:llä mitattavien
signaalien syntymekanismeja aivoissa ja EEG:n mittausperiaatteita.
Lisäksi perehdytään joihinkin EEG:n
sovelluksiin. Kurssin pääpaino on EEG-mittauksiin ja
tulosten analysointiin tutustuminen
käytännössä. Harjoituksissa
tehdään EEG-kokeita ja analysoidaan tuloksia
pienryhmissä.
Suorittaminen: Luentoraportit, harjoitukset.
Kirjallisuus: Ilmoitetaan kurssin alussa.
Esitiedot: S-114.1710 Kognitiivinen neurotiede tai vastaavat tiedot.
Lisätietoja: Kurssi järjestetään
yhdessä Helsingin yliopiston kognitiotieteen oppiaineen kanssa.
S-114.3812 Laskennallinen neurotiede (6 op)
II (parillisina vuosina)
Opettaja: TkT Harri Valpola, TkT Jarmo Hurri (Helsingin yliopisto)
Sisältö: Kurssilla perehdytään
laskennallisten menetelmien käyttämiseen
hermosolujen, hermosolujoukkojen ja hermostollisten systeemien
toiminnan kvantitatiivisessa mallintamisessa.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyö
Kirjallisuus: Dayan, P., Abbot, L. F.: Theoretical Neuroscience (MIT
Press, 2001)
Lisätietoja: Luennoidaan englanniksi. Korvaa S-114.3811,
S-114.811.
I-II tai III-IV
Opettaja: prof. Jouko Lampinen, akatemiaprof. Kimmo Kaski
Sisältö: Vaihtuva-alainen kurssi
tietokonesimulaatiosta ja - mallinnuksesta etenkin informaatiotekniikan
ja talouden aloilta.
Suorittaminen: Tentti tai laajahko ohjelmatyö.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.150
III-IV
Opettaja: prof. Jouko Lampinen
Sisältö: Kurssin sisältö vaihtelee
vuosittain. Kurssin tavoitteena on antaa lisensiaattitasoista opetusta
laskennalliseen tekniikkaan liittyvästä
aihepiiristä. Kurssi voi olla luento- tai seminaarimuotoinen.
Suorittaminen: Suoritustavasta sovitaan erikseen vuosittain.
Kirjallisuus: Oppikirja tai kokoelma artikkeleita, ilmoitetaan kurssin
alussa.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.202.
III-IV
Opettajat: prof. Jouko Lampinen, dos. Kaisa Tiippana, dos. Aapo
Hyvärinen (Helsingin yliopisto)
Sisältö: Kurssilla tarkastellaan ihmisen
näköhavaitsemisen mekanismeja ja niiden
mallintamista. Kurssin painopiste on visuaalisen piirreirrotuksen ja
esineiden havaitsemisen malleissa.
Suorittaminen: Tentti ja harjoitustyöt.
Kirjallisuus: Ilmoitetaan kurssin alussa.
Esitiedot: Perustiedot differentiaali- ja
todennäköisyyslaskennasta sekä algebrasta.
Perustiedot ihmisen
näköjärjestelmän toiminnasta
suositeltavia (esim. Havaitseminen ja toiminta tai Ihmisaivojen rakenne
ja toiminta tai Fysiologia-kurssit).
Lisätietoja: Luennoidaan englanniksi.
Järjestetään yhdessä Helsingin
yliopiston Tietojenkäsittelytieteen laitoksen kanssa.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.204.
I-II, III-IV
Opettaja: prof. Jouko Lampinen (vastaava)
Sisältö: Vuosittain vaihtuva aihe liittyy johonkin
ajankohtaiseen laskennallisen tekniikan alan tutkimusongelmaan.
Suorittaminen: Aktiivinen osallistuminen ja seminaariesitelmien
pitäminen.
Lisätietoja: järjestetään
tarvittaessa sekä I-II että III-IV periodeilla.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.220.
S-114.4230 Yksilöllisiä laskennallisen tekniikan opintoja (1-8 op) L V
voi suorittaa millä tahansa periodilla
Opettajat: prof. Jouko Lampinen, akat.prof. Kimmo Kaski, prof. Jukka
Tulkki, dos. Mika Ala-Korpela; PhD Riku Linna; FT Riikka
Möttönen; TkT Jari Saramäki; dos. Kaisa
Tiippana; TkT, KTT Juuso Töyli; TkT Harri Valpola; dos. Aki
Vehtari.
Sisältö: Yksilöllisten opintojen
sisällöstä ja laajuudesta vastaavan
opettajan kanssa etukäteen.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.230
I-IV
Opettaja: prof. Jouko Lampinen, prof. Jukka Tulkki, akatemiaprof. Mikko
Sams, akatemiaprof. Kimmo Kaski
Sisältö: Seminaarissa
käsitellään laskennallisen tekniikan
laboratorion tutkimusaloihin liittyviä aiheita. Kurssi on
pääasiallisesti tarkoitettu laboratorion
jatko-opiskelijoille ja tutkijoille.
Suorittaminen: Aktiivinen osallistuminen (1 ov) ja
seminaariesitelmä n pitäminen (1 ov).
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.245
I-II tai III-IV
Opettaja: Ph.D. Mikko Karttunen
Sisältö: Molekyylimallinnuksen perusteet,
kvanttimekaaniset mallit, empiiriset voimakenttämallit,
molekyylidynamiikan ja Monte Carlon menetelmän
käyttö, minimointimenetelmät
molekyylilaskennassa, konformaatioanalyysi, molekyylimallinnuksen
käyttö uusien molekyylien ja
lääkeaineiden suunnittelussa, molekyylilaskennan
tulevaisuuden haasteita.
Suorittaminen: Luennot, harjoitukset ja tentti: 4 ov. Luennot,
harjoitukset, tentti ja projektityö: 6 ov.
Kirjallisuus: A.R.Leach: Molecular Modeling: Principles and
Applications sekä luentomuistiinpanot.
Esitiedot: S-114.250, laskennallinen fysiikka tai vastaavat tiedot.
Statistisen mekaniikan ja termodynamiikan perustiedot.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.260.
I-II tai III-IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Kurssilla
käsitellään erilaisia solubiologian
mallintamismenetelmiä, pääpaino ollen solun
dynamiikassa. Muita aiheita ovat ionikanavat, solun ionitasapainon
mallinnus, solujenvälisen tiedonsiirto, entsymaattinen
säätely, molekyylimoottorit.
Kirjallisuus: Luentomuistiinpanot. Kurssi perustuu suurelta osin
kirjaan Computational Cell Biology, C.P. Fall et al. Esitiedot:
suositellaan Matematiikka I-III ja Laskennallisen tieteen peruskurssi
(S114.100)
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.27
III-IV
Opettaja: dos. TkT Aki Vehtari
Sisältö: Kurssin sisältö vaihtelee
vuosittain. Kurssin tavoitteena on antaa lisensiaattitasoista opetusta
bayesilaiseen mallintamiseen
liittyvästä aihepiiristä. Kurssi voi olla
luento- tai seminaarimuotoinen.
Suorittaminen: Opintojakson suoritustavasta sovitaan erikseen
vuosittain.
Kirjallisuus: Oppikirja tai kokoelma artikkeleita, ilmoitetaan kurssin
alussa.
Esitiedot: Bayesilaisen mallintamisen perusteet.
S-114.4612 Bayesilaisen mallintamisen erikoiskurssi II (1-8 op) L V
I tai II tai III tai IV
Opettaja: dos. Aki Vehtari
Sisältö: Kurssin sisältö vaihtelee
vuosittain. Kurssin tavoitteena on antaa lisensiaattitasoista opetusta
bayesilaiseen mallintamiseen liittyvästä
aihepiiristä. Kurssi voi olla luento- tai seminaarimuotoinen.
Suorittaminen: Opintojakson suoritustavasta sovitaan erikseen
vuosittain.
Kirjallisuus: Oppikirja tai kokoelma artikkeleita, ilmoitetaan kurssin
alussa.
Esitiedot: Bayesilaisen mallintamisen perusteet
I tai II tai III tai IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Vuosittain vaihtuva aihe liittyy johonkin
ajankohtaiseen alan tutkimusongelmaan.
Suorittaminen: Aktiivinen osallistuminen seminaariin ja
seminaariesitelmien pitäminen.
Kirjallisuus: Esitellään opetuksen
yhteydessä.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.740.
I tai II tai III tai IV
Opettaja: N.N.
Sisältö: Vuosittain vaihtuva aihe liittyy johonkin
ajankohtaiseen alan tutkimusongelmaan. Jakso voidaan
pitää yhteisenä muiden laboratorioiden
opetuksen kanssa. Suorittaminen: Aktiivinen osallistuminen ja
seminaariesitelmien pitäminen.
Kirjallisuus: Esitellään opetuksen
yhteydessä.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.720.
I tai II tai III tai IV
Opettajat: akatemiaprof. Mikko Sams, ma. prof. Iiro
Jääskeläinen ,tutkija Kaisa Tiippana,
tutkija Jari Kätsyri
Sisältö: Kognitiivisen tieteen ja teknologian
aihnepiiriin liittyvä erikoistyö.
Suorittaminen: Sovitaan valvovan opettajan kanssa.
Kirjallisuus: Sovitaan valvovan opettajan kanssa.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.745.
I tai II tai III tai IV
Opettajat: akat. prof. Mikko Sams, akat. prof. Kimmo Kaski, prof. Jouko
Lampinen, prof. Jukka Tulkki, dosentti Jukka Heikkonen, ma. prof. Iiro
Jääskeläinen, PhD Kaisa Tiippana, PhD Jari
Kätsyri, prof. Kari-Jouko Räihä
Sisältö: Yksilöllisten opintojen
sisällöstä ja laajuudesta sovitaan vastaavan
opettajan kanssa etukäteen.
HUOM: Tämä kurssi korvaa kurssin S-114.750.
S-114.7220 Muisti ja oppiminen (3 op)
jakso 4
Opettaja: N.N.
Sisältö: Kurssilla perehdytään
ihmisen muistijärjestelmiin ja niiden keskushermostolliseen
perustaan. Sensorinen muisti, työmuisti ja tarkkaavaisuus,
pitkäkestoinen muisti. Episodinen muisti ja semanttinen
muisti. Muistin häiriöt. Muistin hermosolu- ja
hermoverkkomalleja.
Suorittaminen: Tentti.
Kirjallisuus: Ilmoitetaan kurssin alussa.