|
S-114.240 Laskennallisen tekniikan seminaari |
Kevät
2005 - Kurssi luennoidaan kaksi kertaa toisiaan
täydentävästä aiheesta (2 ov per kurssi):
Seminaarien tarkoituksena on harjoitella esitelmän (tutkimuksen) laatimista, esittämistä ja rakentavaa kritisointia.
Kevään 2005 ensimmäisen
seminaarin aiheena on: Laskennalliset menetelmät
biologisten systeemien ymmärtämisessä.
Seminaarin osallistujat jatkavat yhdessä luentomonisteen
suunnittelua (edellisen seminaarin tuottaman monisteen pohjalta) TKK:n
Bioinformaatioteknologian koulutusohjelman uudelle peruskurssille,
jonka nimi on Laskennalliset menetelmät biologisten systeemien
ymmärtämisessä.
Kevään 2005 toisen
seminaarin aiheena on: Kokeelliset menetelmät biologisten
systeemien ymmärtämisessä.
Seminaarin osallistujat suunnittelevat yhdessä luentomonisteen
(ensimmäisen version) TKK:n Bioinformaatioteknologian
koulutusohjelman uudelle peruskurssille,
jonka nimi on Kokeelliset menetelmät biologisten systeemien
ymmärtämisessä.
Molemmat seminaarit toimivat
samalla periaatteella, vain aiheiden fokus on erilainen.
Kukin seminaariin osallistuva opiskelija valitsee henkilökohtaisen aiheen, josta tulee kirjoittaa kirjallinen tutkimus / selvitys, ja joka tulee alustavasti ja lopullisesti esittää seminaarissa. Opiskelijat yhdessä huolehtivat siitä, että luentomonisteesta tulee looginen ja kattava kokonaisuus otsikon mukaisesta aiheesta.
Pääpaino seminaareissa tulee olemaan aiheen modulaarisessa tarkastelussa, eri mittakaavojen ja aikaskaalojen havainnollistamisessa ja kullekin systeemille ja ongelmalle sopivien laskennallisten / kokeellisten menetelmien perusteiden ymmärtämisessä sekä laskennallisesti / kokeellisesti tuotetun tiedon vertaamisessa. Seminaarissa painotetaan ryhmätyön merkitystä ja rakentavaa kritisointia ja keskustelua.
Alle on merkitty väliraporttien ja loppuesityksen ehdottomat
palautuspäivät -
työt tulee palauttaa sähköpostilla;
myöhästyneitä töitä ei oteta käsittelyyn.
Huomatkaa
dokumenttiin tulevien kuvien koon optimoin niin, että dokumentin
koko ei kasva hulvattomaksi! Dokumentin ensisijainen formaatti on MS
Word; myös pdf-dokumentit kelpaavat.
| Aika | Paikka | Aihe | Materiaali |
|---|---|---|---|
| Tiistai 18.01.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali E332 |
ALUSTUSLUENTO: Materia, mittakaavat ja aikaskaalat: kvarkeista galakseihin, vibraatiovärähdyksistä sydämen lyönteihin, ab initiosta Monte Carloon. Keskustelua asiakokonaisuudesta ja aihepiirin rajaus yhdessä työmäärittelyn mukaisesti. Opiskelijoiden seminaaritöiden aiheiden valinta. |
Tutustutaan edellisen kurssin tuottamaan monisteen pohjaan |
| Tiistai 15.02.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali D320 |
Opiskelijoiden seminaaritöiden väliraporttien
läpikäyntiä ja pohdintaa. Asiakokonaisuuden täsmentämistä. |
Kurssin väliraportit |
| Tiistai 01.03.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali E332 |
Opiskelijoiden seminaaritöiden loppuraporttien pohjalta
laaditut esitelmät. Nauttimista hyvistä ja mielenkiintoisista esitelmistä. HUOM! ESITYKSET 30 MIN + 5 MIN KESKUSTELUA |
Kurssin loppuraportit |
Dissipatiivinen
partikkelidynamiikka --- Jussi Vatilo
Mesoskaalan
menetelmien
vertailu --- Tapio Nieminen (vain osa seminaarityötä)
Proteiinien
rakenne ja
funktio sekä laskostumisen ennustaminen --- Janne
Pylkkönen
Viruksen
rakenne --- Jaakko Riihimäki
Itsejärjestäytyminen
(ja rasva-aineet) --- Janne Ojanen
Neurolaskennan
sovellukset
biologisten systeemien mallinnuksessa --- Matti
Pöllä
T
Ä Ä L L Ä L U E N T O M O N I S T E E N U U
S I S U U N N I T E L M A
eli tällä kurssilla
toteutettavat täydennykset.
Alle on merkitty väliraporttien ja loppuesityksen ehdottomat palautuspäivät - työt tulee palauttaa sähköpostilla; myöhästyneitä töitä ei oteta käsittelyyn. Huomatkaa dokumenttiin tulevien kuvien koon optimoin niin, että dokumentin koko ei kasva hulvattomaksi! Dokumentin ensisijainen formaatti on MS Word; myös pdf-dokumentit kelpaavat.
| Aika | Paikka | Aihe | Materiaali |
|---|---|---|---|
| Tiistai 15.03.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali E332 |
ALUSTUSLUENTO: Materia, mittakaavat ja aikaskaalat -- miten biosysteemejä voidaan tutkia; mitä ja miten mitäkin mitataan? Keskustelua asiakokonaisuudesta ja aihepiirin rajaus yhdessä työmäärittelyn mukaisesti. Opiskelijoiden seminaaritöiden aiheiden valinta. |
--- |
| Tiistai 12.04.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali E332 |
Opiskelijoiden seminaaritöiden väliraporttien
läpikäyntiä ja pohdintaa - I / II. Asiakokonaisuuden täsmentämistä. |
Kurssin väliraportit |
| Keskiviikkko 13.04.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali E332 |
Opiskelijoiden seminaaritöiden väliraporttien
läpikäyntiä ja pohdintaa - II / II. Asiakokonaisuuden täsmentämistä. |
Kurssin väliraportit |
| Tiistai 03.05.2005 9.15 - 16.00 |
Innopoli 2 sali E332 |
Opiskelijoiden seminaaritöiden loppuraporttien pohjalta
laaditut esitelmät. Nauttimista hyvistä ja mielenkiintoisista esitelmistä. |
Kurssin loppuraportit |
Seminaariesitelmät (alustava ja finaali eli yhteensä 2
kpl per seminaari) ja kirjalliset (alustava ja finaali eli
yhteensä 2
kpl per seminaari) versiot omasta aihepiiristä.
Läsnäolo seminaarin
luennoilla on pakollinen kurssin hyväksyttyyn suoritukseen.
Ei tenttiä; seminaarityöt ja -esitykset arvostellaan.
Luennoilla ilmoitettava materiaali ja kuhunkin aiheeseen liittyvä spesifinen kirjallisuus ja tietolähteet.
Suositellaan kahden ensimmäisen vuoden matematiikan ja fysiikan
opinnot, mutta avoin mieli ja ymmärtämisen halu
siivittävät pitkälle.
Dosentti, FT Mika Ala-Korpela
Opettava tutkija
Teknillinen korkeakoulu
Laskennallisen tekniikan laboratorio
Email: mika.ala-korpela@hut.fi
Gsm: 050 35 35 457